Virus siêu đa hình là loại virus tự động biến đổi mã mỗi khi lây nhiễm, vì vậy, các công cụ diệt virus dựa trên mẫu có sẵn sẽ rất khó phát hiện ra chúng. Để thực hiện điều này, virus siêu đa hình được trang bị một số cách thức biến đổi siêu hình như đổi tên thanh ghi, hoán vị mã, mở rộng mã, rút gọn mã và chèn những đoạn mã rác vào... nhằm đánh lừa và tránh sự phân tích.