Năm 2016, Học viện Kỹ thuật mật mã tiếp tục tuyển sinh 600 chỉ tiêu kỹ sư chuyên ngành An toàn thông tin. Đặc biệt, từ năm 2016, lần đầu tiên Học viện tuyển sinh chuyên ngành “Kỹ thuật phần mềm nhúng và điện thoại di động” với 120 chỉ tiêu. Đây cũng là chuyên ngành hoàn toàn mới, lần đầu tiên ra mắt tại Việt Nam.